图形工作站、集群应用方案
  • 网站首页
  • 商城
  • 产品
  • 行业计算
  • 科学工程计算
  • 化学&生物
  • 图形设计
  • 图像处理
  • 视景仿真
  • 人工智能
  • 影视后期
全球领先的高端图形工作站供应商

免费测试 热线 : 400-7056-800 【 为任何应用提供 最快计算设备 如不符,退货】【最新报价】【选购指南】【京东商城】



企业通用模版网站

  • 科研团队全能超算平台25v1
  • 超高分拼接 数字孪生
  • 科学计算MatLAB工作站24
  • 地质建模 油藏模拟工作站
  • 工业CT扫描 机器视觉计算
  • 电力系统关键应用配置24
  • 网站首页
  • 商城
  • 产品
  • 行业计算
  • 科学工程计算
  • 化学&生物
  • 图形设计
  • 图像处理
  • 视景仿真
  • 人工智能
  • 影视后期
  • 送无人机啦 8核6.4GHz  96核4.8GHz 加速改装 

  • 高性能集群 虚拟并行计算 芯片设计 光学仿真 

  • 蛋白质预测 生物信息 冷冻电镜 材料模拟

  • RSS订阅
  • 理科计算推荐
  • 仿真计算最快最完美25v1
  • 电磁仿真单机与集群25v1
  • 航拍实景建模单机集群
  • 遥感图像处理工作站集群
  • 4K/8K剪辑特效调色24v1
  • AI大模型工作站集群25v1
  • Abaqus硬件配置大全24v3
  • CST电磁仿真工作站25v1
  • 多物理场仿真单机与集群
  • 流体/空气动力学仿真25v1
  • 量子化学 分子动力模拟
  • 三维设计24v2  3D打印

 

您的位置:UltraLAB图形工作站方案网站 > 化学&生物 > 药物筛选/分子对接 > Materials Studio建模与材料模拟计算工作站方案2021v4

Materials Studio建模与材料模拟计算工作站方案2021v4

时间:2021-11-08 03:14:00   来源:UltraLAB图形工作站方案网站   人气:25594 作者:admin

重点
(1)Materials Studio材料模拟软件计算特点
(2)Materials Studio三维建模/可视化硬件配置推荐
(3)Materials Studio量子力学工作站硬件配置推荐
(4)Materials Studio分子力学与分子动力工作站硬件配置推荐


(一)Materials Studio材料模拟软件介绍

Materials Studio(简称MS)是分子模拟领域内的多种模拟方法以及建模可视化性质分析工具。提供三维结构模型,对各种晶体、无定型以及高分子材料的性质及相关过程进行深入的研究。可以从电子、原子以及高分子的角度去分析物质的结构与性质 利用的主要方法为:以密度泛函为主的量子力学模拟方法、分子力学和分子动力学模拟方法、蒙特卡罗模拟法、介观动力学(MesoDyn)和耗散粒子动力学(DPD)、统计方法QSAR等多种先进算法和X射线衍射分析等仪器分析方法,根据系统中的原子、分子的类型和数目,研究、预测材料的相关性质。模拟的内容包括了催化剂、聚合物、固体及表面、界面、晶体与衍射、化学反应等材料和化学研究领域的主要课题。
A750-MS1.jpg


(二)Materials Studio软件计算特点

2.1 MS求解器支持单机CPU、GPU卡、MPI多机集群情况

如何配置一台具有高性能能力的图形工作站(CPU、内存、硬盘、显卡),需要对其算法特点、以及计算规模进行分析

No

分类

模块

功能描述

CPU并行

GPU加速

集群

1

可视化分析

Materials Visualizer

材料可视化工具

搭建分子、晶体及高分子材料结构模型

 

 

 

2

量子力学类

DMol³

密度泛函量子力学程序原子轨道线性组合法,计算能带、态密度

√

 

√

CASTEP

材料科学量子力学程序平面波赝势密度泛函法,模型较小,包含数十、乃至数百个原子

√

 

√

NMR CASTEP

MS CASTEP的扩展模块

晶胞进行几何优化,若精度要求较高

√

 

 

ONETEP

进行线性标度密度泛函模拟

√

 

√

DFTB+

半经验量子力学程序

密度泛函的紧束缚法模拟体系大,对数千个原子体系进行模拟

√

 

√

VAMP

半经验量子力学程序

原子轨道线性组合方法,对于涉及电子得失或转移的过程(诸如涉及化学反应的过程)的模拟

 

 

 

Cantera

化学反应速率方程求解器

 

 

 

QMERA

 量子力学与分子力学的杂化方法

√

 

 

 3

分子力学与分子动力学类 

COMPASS

对凝聚态材料进行原子水平模拟的功能强大的力场,模型中等大小,包含数千至数万个原子

√

 

 

Forcite Plus

分子和周期性体系的经典力学模拟工具

√

√

√

GULP

基于分子力场的晶格模拟程序

√

 

√

Equilibria

计算烃类化合物单组分体系或多组分混合物的相图

 

 

 

Sorption

预测基础性质,比如吸附等温线(或加载曲线)和亨利常数

 

 

 

Mesocite

 

√

√

√

4

蒙特卡洛类

Amorphous Cell

对复杂的无定型系统建立有代表性的模型,并对主要性质进行预测,模型较大,包含大量的原子(数万乃至更多)

 

 

 

Adsorption Locator

蒙特卡洛退火方法

 

 

 

Blends

 

 

 

 

Conformers

为柔性分子结构提供构像搜索算法和分析工具

 

 

 

Sorption

巨正则蒙特卡洛法

预测基础性质,比如吸附等温线(或加载曲线)和亨利常数

 

 

 

5

高分子与介观模拟类

Synthia

提供对聚合物材料性质的快速预测:包括热力学、力学和输运性质等。

 

 

 

Blends

预测相的行为及得到相图。

 

 

 

DPD

 

 

 

 

Mesocite

分子力学工具集,粗粒化分子动力学以及耗散粒子动力学两种方法

√

√

√

MesoDyn

动态平均场密度泛函方法

√

 

√

MesoPro

 

 

 

 

6

晶体、结晶与X射线衍射类

Polymorph Predictor

蒙特卡洛模拟退火法

多晶型预测

√

 

 

Morphology

形态学

 

 

 

X-Cell

指示中等和高质量的粉末衍射数据,包括来自 X 光、中子或是电子辐射源的衍射数据

 

 

 

Reflex

模拟晶体材料的X光、中子以及电子等多种粉末衍射图谱

 

 

 

Reflex Plus

 

 

 

 

Reflex QPA

 

 

 

 

CCDC

 

 

 

 

7

定量结构-性质关系类

QSAR

 

 

 

 

QSAR Plus

利用光学物理化学性质来鉴定化合物

 

 

 

Synthia

 

 

 

 


计算规模划分

simulation-scale.jpg
 
≤ 100个原子  ab initio/DFT
100~200个原子  半经验
>200个原子   用QM/MM模型
从而找出更好的算法,通过分析算法,给出最佳的硬件配置

2.2 MS材料模拟建模计算特点
如何既保证建模模型流畅,又保证配置合理,计算速度理想具体情况具体分析,
建模就是画出三维图形,创建原子3D模型、流畅旋转、移动等,对应硬件要求:
CPU :更高的主频,
内存容量:≥48GB
显卡:容量≥8GB,支持OpenGL,nvidia图卡
显示器:高分辨率最佳
2560*1440(2K)
3840*2160(4K)
7680*4320(8K)…
19200*4320(拼接超高分辨率)

2.3 量子力学类算法计算特点
主要算法是密度泛函理论(DFT),计算规格是平面波数量的3 次方成正比(N3),
硬件配置特点:CPU有限多核并行、内存带宽、内存容量是重点

第一类,密度泛函(DFT): 内存容量大,大量I/O临时文件
第二类:平面波赝势密度泛函: CPU算力、内存容量、内存带宽
如果追求最快算力,只有四路Xeon架构最合适(高主频+并行核数+24通道)

2.4 分子力学与分子动力学类算法计算特点
经典分子动力学模拟中,计算成本取决于原子数N,分子动力学不会占用太多内存,以CPU算力为主,由于输出大量轨迹数据,需要大容量硬盘,
硬件配置特点:CPU  算力越大越好, GPU  Mesocite、Forcite模块支持单GPU卡,加速,硬盘配备大容量
#p#page_title#e#
(三)Materials Studio工作站硬件配置推荐

西安坤隆计算机科技有限公司专注于图形工作站应用,为软件要求提供合理计算架构,我们通过对Materials Studio材料模拟软件和其主要算法计算特点资料查阅、分析和重要功能模块测试,以intel最新计算架构为主,给出高效率精准配置工作站硬件配置方案,每台计算工作站通过经验丰富的工程师整机、系统级优化,以及在线技术支持,保证机器三年内处于高速、高效、可靠运行状态。


GX650M-MS2.jpg
相关机型 A300/H390、EX650i、Alpha730/Alpha750

3.1 Materials Studio三维建模可视化硬件配置推荐
配置关键点:CPU高主频,内存容量尽可能高,高显存专业图卡,高分辨率显示器

NO

品牌与型号

配置规格

价格

备注

1.1

AX300 14964-MAC

Intel 11代高频处理器(6核@4.9GHz)/64GB/RTX4000 8GB /1TB PCIeSSD /4TB SATA企业级/塔式(750w)/24寸-2K图显

36500

高性价比

1.2

AX300 150128-MAC

Intel 11代高频处理器(8核@5.0GHz)/128GB/RTX A4000 16GB/1TB PCIeSSD /4TB SATA企业级/塔式(750w)/24寸-2K图显

46500

高性能型

1.3

H390 151128-MBD

Intel 11代高频处理器(10核@5.1GHz)/128GB/ RTX A5000 24GB/2TB PCIeSSD /4TB SATA企业级/塔式(750w)/24寸-2K图显

67000

极致型

1.4

EX650i 233256-MBB

2颗Xeon 金牌4316(40核@4.1GHz)/256GB DDR4 /RTX  A5000 24GB/2TB Pcie-SSD /6TB SATA企业级/塔式(750w)/27寸-4K图显

88000

全能高效型

1.5

Alpha730 441384-SCC

4颗Xeon 金牌6246(48核@4.1GHz)/384GB DDR4 /RTX A4000 16GB /3.84TB SSD /16TB SATA企业级/塔式(750w)/27寸-4K高清图显

218000

全能高速型

1.6

Alpha750 441768-SCD

4颗Xeon 金牌6328H(64核@3.7GHz)/768GB DDR4 /RTX A5000 24GB /3.84TB SSD /16TB SATA企业级/塔式(750w)/27寸-4K图显

226000

全能多用户多任务型


#p#page_title#e#
3.2 Materials Studio量子力学工作站硬件配置推荐
配置特点:CPU理想核数和高主频,内存带宽最大化、容量尽可能高

NO

品牌与型号

配置规格

价格

备注

2.1

EX650i 235192-MAA

2颗Xeon 金牌4314(32核@3.5GHz)/192GB DDR4 /Quador P620 /1TB Pcie-SSD /6TB SATA企业级/塔式(750w)/24寸-2K图显

48500

超值型

2.2

EX650i 235256-MAA

2颗Xeon 金牌4316(40核@4.1GHz)/256GB DDR4 /Quador P620 /1TB Pcie-SSD /6TB SATA企业级/塔式(750w)/24寸-2K图显

59000

高性能型

2.3

EX650i 233256-MBA

2颗Xeon 金牌5320(52核@3.3GHz)/256GB DDR4 /Quador T600 /2TB Pcie-SSD /8TB SATA企业级/塔式(750w)/24寸-2K图显

72000

高性能加强型

2.4

EX650i 233512-MBA

2颗Xeon 金牌6348(56核@3.3GHz)/512GB DDR4 /Quador T600 /2TB Pcie-SSD /10TB SATA企业级/塔式(750w)/24寸-2K图显

110000

超大规模计算型

2.5

Alpha730 441384-SCB

4颗Xeon 金6246(48核@4.1GHz)/384GB /QuadroP2000 /3.84TB SSD/16TB SATA企业级/双塔式(双1000w)/27寸-4K图显

210000

超大规模计算完美型

2.6

Alpha730 443768-SCB

4颗Xeon 金6256(48核@4.3GHz)/768GB /QuadroP2000 /3.84TB SSD/2*16TB SATA企业级/双塔式(双1000w)/27寸-4K图显

268000

超大规模计算极致型

2.7

Alpha750 433768-SCB

4颗Xeon 金5320H(80核@3.3GHz)/768GB /QuadroP2000 /3.84TB SSD/2*16TB SATA企业级/双塔式(双1000w)/27寸-4K图显

185000

超大规模计算多任务型

2.8

Alpha750 4331T-PCB

4颗Xeon 铂金8360H(96核@3.8GHz)/1.5TB /QuadroP2000 /4TB PCIeSSD/2*16TB SATA企业级/双塔式(双1000w)/27寸-4K图显

355000

超大规模计算极致多任务型

#p#page_title#e#
3.3 Materials Studio分子力学与分子动力工作站硬件配置推荐
配置特点:CPU理想核数和高主频、或GPU加速,硬盘高io大容量

NO

品牌与型号

配置规格

价格

备注

2.1

EX650i 23596-MBA

2颗Xeon 金牌4314(32核@3.5GHz)/96GB DDR4 /Quador P620 /2TB Pcie-SSD /8TB SATA企业级/塔式(750w)/24寸-2K图显

44500

超值型

2.2

EX650i 235128-MBA

2颗Xeon 金牌4316(40核@4.1GHz)/128GB DDR4 /Quador P620 /2TB Pcie-SSD /10TB SATA企业级/塔式(750w)/24寸-2K图显

53990

高性能型

2.3

EX650i 235128-MBC

2颗Xeon 金牌4316(40核@3.5GHz)/128GB DDR4 /RTX A5000 24GB /2TB Pcie-SSD /10TB SATA企业级/塔式(865w)/24寸-2K图显

79990

高性能GPU加速型

2.4

EX650i 233256-MBA

2颗Xeon 金牌6348(56核@3.3GHz)/256GB DDR4 /Quador T600 /2TB Pcie-SSD /16TB SATA企业级/塔式(865w)/24寸-2K图显

96000

超大规模计算型

2.5

EX650i 235256-MCD

2颗Xeon 金牌6342(48核@3.5GHz)/256GB DDR4 /RTX A5000 24GB/4TB Pcie-SSD /16TB SATA企业级/塔式(865w)/24寸-2K图显

122000

超大规模计算高性能全能型

2.6

Alpha750 433384-PCC

4颗Xeon 金5320H(80核@3.3GHz)/384GB /RTX A4000 16GB/960G SSD/4TB PCIeSSD /16TB SATA企业级/双塔式(双1000w)/27寸-4K图显

179990

超大规模计算全能多任务型

2.7 Alpha750 433384-PCE

4颗Xeon 金5320H(80核@3.3GHz)/768GB /RTX A6000 48GB/960G SSD/4TB PCIeSSD /3*16TB SATA企业级/双塔式(双1000w)/27寸-4K图显

255000 超大规模计算GPU全能多任务型

2.8

Alpha730 431768-PCD

4颗Xeon 铂金8260(96核@3.1GHz)/768GB /RTX A5000 24GB/960GB SSD/4TB PCIeSSD/3*16TB SATA企业级/双塔式(双1000w)/27寸-4K图显

280000

超大规模计算极致全能型

2.9 Alpha730 432768-PCC

4颗Xeon 铂金8270(104核@3.2GHz)/768GB /RTX A4000 24GB/960GB SSD/4TB PCIeSSD/3*16TB SATA企业级/双塔式(双1000w)/27寸-4K图显

320000 超大规模计算极致多任务型

2.10

Alpha750 438768-PCE

4颗Xeon 铂金8360H(96核@3.8GHz)/768GB / RTX A5000 24G /960GB SSD/ 4TB PCIeSSD/3*16TB SATA企业级/双塔式(双1000w)/27寸-4K图显

350000

超大规模极致多任务异构计算型

 

上述所有配置,代表最新硬件架构,同时保证是最完美,最快,如有不符,可直接退货

欲咨询机器处理速度如何、技术咨询、索取详细技术方案,提供远程测试,请联系

 

UltraLAB图形工作站供货商:
西安坤隆计算机科技有限公司
国内知名高端定制图形工作站厂家
业务电话:
400-705-6800

咨询微信号:
xasun001-ewm2.png

 

关闭此页
上一篇:Schrodinger薛定谔分子动力模拟与建模工作站推荐2022v2
下一篇:最新最全专业软件汇总与硬件配置/系统要求推荐

相关文章

  • 05/09Xeon6代+4块GPU--图灵超算工作站GT450M介绍
  • 05/09汽车风阻测试模拟分析、算法,及服务器/工作站计算设备硬件配置推荐
  • 04/26高频交易(HFT)应用分析、算法,服务器/工作站硬件配置推荐
  • 04/25衍生品定价与风险对冲应用分析、算法,及服务器工作站硬件配置
  • 04/25量化交易策略应用算法分析、服务器工作站硬件配置
  • 04/24金融风险管理应用算法分析、服务器/工作站硬件配置推荐
  • 04/19油藏模拟软件的算法分析以及图形工作站/服务器硬件配置推荐25v2
  • 04/17大型3D设计软件CATIA-算法分析与图形工作站硬件配置
  • 04/17Cadence EDA主要软件计算特点分析,服务器/工作站硬件配置推荐
  • 04/16Synopsys EDA主要软件计算特点分析,服务器/工作站硬件配置推荐

工程技术(工科)专业工作站/服务器硬件配置选型

    左侧广告图2

新闻排行榜

  • 1Material Studio材料计算的工作站配置方案
  • 2Materials Studio建模与材料模拟计算工作站方案2021v4
  • 3Schrodinger薛定谔分子动力模拟与建模工作站推荐2022v2
  • 4Materials Studio 最强大的材料模拟计算平台
  • 5Schorodinger药物发现、药物设计科研利器-工作站、服务器、团队级计算设备全套方案24v3
  • 6从VASP软件到MedeA平台——计算引擎升级为高级跑车
  • 7最新最全专业软件汇总与硬件配置/系统要求推荐
  • 8稀土资源利用国家重点实验室的计算利器---高速计算设备硬件配置推荐
  • 9药物筛选计算分析与工作站硬件配置推荐
  • 10Alphafold 3蛋白质折叠计算环节分析与高性能硬件配置推荐

最新信息

  • 中医药理药物动力学研究、算法 、配备软件及对计算服务器硬件配置推荐
  • Schorodinger药物发现、药物设计科研利器-工作站、服务器、团队级计算设备全套方案24v3
  • 阿尔兹海默病研究、分析算法及服务器/工作站/存储设备配置推荐
  • Alphafold 3蛋白质折叠计算环节分析与高性能硬件配置推荐
  • 药物筛选计算分析与工作站硬件配置推荐
  • 稀土资源利用国家重点实验室的计算利器---高速计算设备硬件配置推荐
  • 常温超导研究的软件工具和计算设备硬件配置推荐
  • 研究镓和锗材料的计算利器-UltaLAB工作站硬件配置方案

应用导航:

工作站产品中心 京东商城 中关村商城 淘宝商城 超高分可视化商城 便携工作站商城 ANSYS CATIA Microsoft INTEL NVIDIA 网站统计

公司简介-业务咨询-招聘英才-资料下载-UM-

本网站所有原创文字和图片内容归西安坤隆计算机科技有限公司版权所有,未经许可不得转载
陕ICP备16019335号 陕公网安备61010302001314号
Copyright © 2008-2023 , All Rights Reserved

首页
热线
商城
分类
联系
顶部